Незадолго до премьеры фильма ребята ездили в Индию, а также записывали Белый альбом, так что нечасто появлялись на публике. Тем не менее, поклонники о них не забывали: на премьеру пришло так много людей, что пришлось перекрывать движение на улице Пикадилли. Увидеть первый показ фильма захотели много друзей ливерпульской четверки: в Цирк Пикадилли пришли Кит Ричардс из Rolling Stones, а также музыканты из The Who и многие другие.
После показа ребята пошли отмечать триумф на вечеринку в Королевском Ланкастерском отеле.
Мультфильм был снят Джорджем Даннингом, канадским аниматором, который в то время жил в Лондоне.
Сюжет ленты повествует о чудесной и красочной музыкальной стране Пепперленд, где появились нехорошие Синие Злюки, которые принялись замораживать всех направо и налево. Замерз и Ансамбль Клуба Одиноких Сердец Сержанта Пеппера. Юный Фред решает отправиться на поиски Музыки, которая прогонит Синих Злюк.
Во время своего путешествия на Желтой Субмарине Фред встречает группу The Beatles, а также доктора наук Джереми Хиллери — Человека Ниоткуда. Все вместе, дурзья путешествуют по разным морям — Морю Времени, Морю Науки, Морю Монстров и Морю Дырок, и наконец прибывают в Пепперленд. Ребята вновь пробуждают своей музыкой все живое, а Синие Злюки раскаиваются, и становятся добрыми и хорошими.
В последнем эпизоде перед нами предстают уже настоящие, а не нарисованные, Битлз, которые вернулись домой из Пепперленда и привезли с собой сувениры: мотор Желтой Субмарины, половинку дыры из Моря Дырок и немного Любви.
В мультфильме звучат все композиции из альбома Yellow Submarine, а также песни Eleanor Rugby, When I’m Sixty-Four, Nowhere Man, Sgt. Pepper’s Lonely Hearts Club Band, With a Little Help from My Friends, Lucy in the Sky with Diamonds и Love You To.